19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10710 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_10710  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  490  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0355904  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2584  hypothetical protein  29.81 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2740  hypothetical protein  34.32 
 
 
201 aa  62.4  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2316  hypothetical protein  30.43 
 
 
188 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000075431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1099  hypothetical protein  35 
 
 
164 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.623925  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1491  hypothetical protein  33.09 
 
 
184 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20080  protein of unknown function (DUF2017)  32.88 
 
 
211 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0919227  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0988  hypothetical protein  31.25 
 
 
166 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278461  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3765  hypothetical protein  31.94 
 
 
198 aa  52.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2371  hypothetical protein  32.17 
 
 
182 aa  52.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0884  hypothetical protein  31.94 
 
 
231 aa  52.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1322  Domain of unknown function DUF2017  30.23 
 
 
210 aa  52  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.134617  hitchhiker  0.00216166 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1308  hypothetical protein  32.21 
 
 
194 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08340  hypothetical protein  29.86 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1690  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  46.6  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0379903  hitchhiker  0.00000515175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0935  hypothetical protein  29.71 
 
 
174 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal  0.761399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1057  hypothetical protein  31 
 
 
222 aa  43.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3874  hypothetical protein  31.11 
 
 
175 aa  42  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1354  Domain of unknown function DUF2017  27.41 
 
 
165 aa  42  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>