14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04420 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_04420  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  750    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129632  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31820  hypothetical protein  46.76 
 
 
344 aa  275  7e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28850  hypothetical protein  34.81 
 
 
391 aa  176  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.190647 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4428  hypothetical protein  29.07 
 
 
375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4444  hypothetical protein  29.07 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1118  hypothetical protein  32.49 
 
 
354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301061  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07200  hypothetical protein  30.83 
 
 
434 aa  126  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287125  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2199  hypothetical protein  26.85 
 
 
369 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0643  hypothetical protein  32.53 
 
 
550 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.24252  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4332  hypothetical protein  43.84 
 
 
165 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3460  hypothetical protein  30.4 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1302  hypothetical protein  24.4 
 
 
418 aa  46.2  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2887  hypothetical protein  24.14 
 
 
398 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.286834  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1137  hypothetical protein  24.73 
 
 
436 aa  43.9  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>