22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4496 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4496  hypothetical protein  100 
 
 		 717 aa  1320    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211487  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37910  hypothetical protein  29.13 
 
 		 751 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4209  hypothetical protein  32.12 
 
 		 703 aa  136  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4966  hypothetical protein  26.92 
 
 		 706 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3364  hypothetical protein  30.16 
 
 		 711 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3714  hypothetical protein  30.92 
 
 		 728 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.499099  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4532  hypothetical protein  28.99 
 
 		 884 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.796948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3103  hypothetical protein  28.34 
 
 		 835 aa  105  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2141  hypothetical protein  28.38 
 
 		 820 aa  96.7  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0602893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  27 
 
 		 713 aa  95.5  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7323  hypothetical protein  27.08 
 
 		 919 aa  82.4  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.815907 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3573  hypothetical protein  28.14 
 
 		 814 aa  80.9  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.950608 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2544  hypothetical protein  27.76 
 
 		 820 aa  74.3  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.111565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7081  hypothetical protein  26.94 
 
 		 764 aa  65.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6063  hypothetical protein  27.61 
 
 		 811 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.405388  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13944  hypothetical protein  32.48 
 
 		 802 aa  52  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00151105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5488  hypothetical protein  26.97 
 
 		 809 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5399  hypothetical protein  26.97 
 
 		 809 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5775  hypothetical protein  26.77 
 
 		 809 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.551065  normal  0.325529 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31850  hypothetical protein  26.13 
 
 		 741 aa  48.9  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0843  hypothetical protein  29.09 
 
 		 804 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.633938  normal  0.153165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9037  hypothetical protein  23.66 
 
 		 718 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>