50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1560 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1560  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  418  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244317  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6761  hypothetical protein  47.62 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2287  hypothetical protein  48.56 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1709  hypothetical protein  49.75 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0885217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2876  hypothetical protein  39.91 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0620073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15770  hypothetical protein  44.19 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0917731  normal  0.361516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1639  hypothetical protein  38.28 
 
 		 268 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  0.220576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3309  hypothetical protein  39.3 
 
 		 251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0382594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1932  hypothetical protein  39.35 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.748587  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2905  hypothetical protein  38.36 
 
 		 238 aa  125  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2956  hypothetical protein  38.42 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3179  hypothetical protein  36.7 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1632  hypothetical protein  37.02 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000168856 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34720  hypothetical protein  37.91 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0388  hypothetical protein  38.3 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1639  hypothetical protein  35.08 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3294  hypothetical protein  38.8 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.900451  normal  0.652925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1449  hypothetical protein  37.5 
 
 		 223 aa  102  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.301993  hitchhiker  0.00206659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1484  hypothetical protein  36.98 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13090  hypothetical protein  35.27 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253271  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14520  hypothetical protein  37.43 
 
 		 266 aa  96.7  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1407  hypothetical protein  32.26 
 
 		 247 aa  95.9  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.53529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1887  integral membrane alanine and leucine rich protein  31.96 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3908  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.37 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0260  hypothetical protein  28.79 
 
 		 252 aa  92.4  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2255  hypothetical protein  40.58 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.242967  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0492  hypothetical protein  26.7 
 
 		 273 aa  89  5e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.165754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3758  hypothetical protein  33.69 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000411746  normal  0.436025 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2471  hypothetical protein  34.91 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3929  hypothetical protein  38.46 
 
 		 207 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056579  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4529  hypothetical protein  30.21 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5193  hypothetical protein  36.22 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2195  hypothetical protein  36.36 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2241  hypothetical protein  36.36 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0569668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2184  hypothetical protein  36.36 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  hitchhiker  0.00922268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1875  hypothetical protein  31.05 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1080  hypothetical protein  34.62 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.990505  normal  0.0894269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1321  hypothetical protein  35.81 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2125  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  36.92 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1919  hypothetical protein  33.77 
 
 		 260 aa  72  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242813  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24230  hypothetical protein  34.48 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.60384  normal  0.0961367 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5226  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  36.26 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5314  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  36.26 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5606  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  36.26 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453325  normal  0.259216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1519  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12708  hypothetical protein  34.86 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0664757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2576  hypothetical protein  35.16 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4236  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  34.71 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113628  normal  0.351436 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1706  hypothetical protein  31.73 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0678311  normal  0.108804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16150  hypothetical protein  37.39 
 
 		 265 aa  48.9  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.596179  normal  0.161793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>