15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2544 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2544  hypothetical protein  100 
 
 
820 aa  1616    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.186239  normal  0.111565 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37910  hypothetical protein  33.61 
 
 
751 aa  277  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137873  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3364  hypothetical protein  32.59 
 
 
711 aa  135  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4209  hypothetical protein  35.06 
 
 
703 aa  110  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3714  hypothetical protein  27.37 
 
 
728 aa  92  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.499099  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2141  hypothetical protein  31.45 
 
 
820 aa  74.7  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0602893  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4532  hypothetical protein  24.27 
 
 
884 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.796948  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4496  hypothetical protein  26.29 
 
 
717 aa  64.3  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211487  normal  0.179181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4966  hypothetical protein  25.65 
 
 
706 aa  64.3  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3573  hypothetical protein  25.24 
 
 
814 aa  58.9  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.950608 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3103  hypothetical protein  25.67 
 
 
835 aa  58.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7323  hypothetical protein  26.17 
 
 
919 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.815907 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31850  hypothetical protein  25.12 
 
 
741 aa  54.7  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  23.46 
 
 
713 aa  51.6  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4850  hypothetical protein  25.84 
 
 
870 aa  50.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>