49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1407 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1407  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  487  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.53529 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1919  hypothetical protein  49.17 
 
 
260 aa  183  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242813  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16150  hypothetical protein  46.59 
 
 
265 aa  181  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.596179  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1706  hypothetical protein  47.37 
 
 
257 aa  155  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0678311  normal  0.108804 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0260  hypothetical protein  36.73 
 
 
252 aa  142  7e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1632  hypothetical protein  36.28 
 
 
282 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000168856 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0492  hypothetical protein  34.91 
 
 
273 aa  135  5e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.165754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1639  hypothetical protein  33.47 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3309  hypothetical protein  35.55 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0382594  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1639  hypothetical protein  34.12 
 
 
268 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  0.220576 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14520  hypothetical protein  34.72 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1484  hypothetical protein  35.32 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205776  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1449  hypothetical protein  36.32 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.301993  hitchhiker  0.00206659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6761  hypothetical protein  34.11 
 
 
221 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13090  hypothetical protein  37.73 
 
 
234 aa  108  8.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253271  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2876  hypothetical protein  31.88 
 
 
276 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0620073  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2287  hypothetical protein  34.4 
 
 
223 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1875  hypothetical protein  34.03 
 
 
280 aa  97.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1709  hypothetical protein  34.27 
 
 
227 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0885217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2255  hypothetical protein  35.17 
 
 
223 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.242967  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1887  integral membrane alanine and leucine rich protein  34.58 
 
 
215 aa  93.6  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256495  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1519  hypothetical protein  34.93 
 
 
272 aa  90.1  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24230  hypothetical protein  35.35 
 
 
270 aa  90.1  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.60384  normal  0.0961367 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1560  hypothetical protein  33.51 
 
 
222 aa  89.7  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244317  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4529  hypothetical protein  30.77 
 
 
237 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325914  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3758  hypothetical protein  34.69 
 
 
216 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000411746  normal  0.436025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2956  hypothetical protein  31.1 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286801  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5193  hypothetical protein  31.22 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.559211  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2905  hypothetical protein  29.84 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2471  hypothetical protein  30.36 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1932  hypothetical protein  30.04 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.748587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3179  hypothetical protein  30.95 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2241  hypothetical protein  32.5 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0569668  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2184  hypothetical protein  32.5 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.96731  hitchhiker  0.00922268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2195  hypothetical protein  32.5 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3929  hypothetical protein  31.28 
 
 
207 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056579  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0388  hypothetical protein  29.29 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15770  hypothetical protein  29.63 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0917731  normal  0.361516 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3294  hypothetical protein  25.54 
 
 
231 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.900451  normal  0.652925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1321  hypothetical protein  27.9 
 
 
236 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3908  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.09 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12708  hypothetical protein  30.69 
 
 
223 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0664757  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1080  hypothetical protein  30.05 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.990505  normal  0.0894269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2125  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  28.85 
 
 
223 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34720  hypothetical protein  30 
 
 
229 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105852  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5606  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  29.17 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453325  normal  0.259216 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5314  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  29.17 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5226  putative integral membrane alanine and leucine rich protein  29.17 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2576  hypothetical protein  26.26 
 
 
255 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>