20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0884 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0884  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  460  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25080  hypothetical protein  37.26 
 
 
278 aa  109  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1322  Domain of unknown function DUF2017  37.91 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.134617  hitchhiker  0.00216166 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1057  hypothetical protein  36.17 
 
 
222 aa  91.7  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2740  hypothetical protein  33.8 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2584  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2316  hypothetical protein  37.86 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000075431 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1308  hypothetical protein  35.92 
 
 
194 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20080  protein of unknown function (DUF2017)  31.33 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0919227  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10710  hypothetical protein  31.94 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0355904  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3765  hypothetical protein  30.58 
 
 
198 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0618918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1491  hypothetical protein  33.55 
 
 
184 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1099  hypothetical protein  32.37 
 
 
164 aa  52.4  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.623925  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0988  hypothetical protein  32.37 
 
 
166 aa  52  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278461  normal  0.303864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2371  hypothetical protein  31.76 
 
 
182 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1870  hypothetical protein  30.61 
 
 
202 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087636  normal  0.127946 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1690  hypothetical protein  36.94 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0379903  hitchhiker  0.00000515175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1724  hypothetical protein  29.41 
 
 
174 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0935  hypothetical protein  29.68 
 
 
174 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.496148  normal  0.761399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5655  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>