13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0724 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0724  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  717    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1801  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.75 
 
 
507 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.679087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4095  hypothetical protein  27.34 
 
 
521 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.659068 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0730  hypothetical protein  22.59 
 
 
490 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0342  hypothetical protein  29.96 
 
 
639 aa  59.7  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.894241  normal  0.0833552 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0421  hypothetical protein  25.22 
 
 
488 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3891  hypothetical protein  27.34 
 
 
521 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0107  hypothetical protein  27.1 
 
 
527 aa  56.6  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138726 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2611  hypothetical protein  24.24 
 
 
527 aa  56.2  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3106  hypothetical protein  26.67 
 
 
506 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0301  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 
512 aa  52.8  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.141921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1661  hypothetical protein  25 
 
 
474 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1328  hypothetical protein  54.35 
 
 
526 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0459237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>