16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1998 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1998  GTP cyclohydrolase III  100 
 
 
268 aa  542  1e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2188  GTP cyclohydrolase III  52.21 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0683488  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1598  GTP cyclohydrolase IIa  52 
 
 
253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3329  GTP cyclohydrolase IIa  52.02 
 
 
254 aa  251  6e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.828115  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2633  GTP cyclohydrolase IIa  51.84 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.808385  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0818  GTP cyclohydrolase III  43.04 
 
 
272 aa  202  7e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.755555  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1393  GTP cyclohydrolase III  43.46 
 
 
266 aa  198  7e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1403  GTP cyclohydrolase III  43.88 
 
 
266 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0505  GTP cyclohydrolase III  43.46 
 
 
266 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1233  GTP cyclohydrolase III  43.46 
 
 
266 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0458897  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1614  GTP cyclohydrolase IIA  27.35 
 
 
251 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0384  GTP cyclohydrolase IIA  25.1 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.22559 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1351  GTP cyclohydrolase IIA  23.98 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0394455 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1743  GTP cyclohydrolase IIA  24.69 
 
 
221 aa  63.2  0.000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0670897 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0049  GTP cyclohydrolase IIA  25.63 
 
 
230 aa  62  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0787957  normal  0.474293 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1123  GTP cyclohydrolase IIA  26 
 
 
221 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.821112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>