27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1956 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  100 
 
 		 103 aa  206  7e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1171  Ribosomal protein S24e  86.41 
 
 		 101 aa  172  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.538794  normal  0.934436 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2393  30S ribosomal protein S24e  72.82 
 
 		 102 aa  148  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3055  Ribosomal protein S24e  74.73 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1271  Ribosomal protein S24e  72.53 
 
 		 106 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  47.31 
 
 		 99 aa  95.9  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0282  30S ribosomal protein S24e  43.69 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2283  30S ribosomal protein S24e  41.76 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000399836  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1194  30S ribosomal protein S24e  42.86 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1440  30S ribosomal protein S24e  41.76 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.17753 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0468  30S ribosomal protein S24e  41.76 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1428  30S ribosomal protein S24e  40.66 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  38.89 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0283  30S ribosomal protein S24e  36.27 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.568514  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2866  ribosomal protein S24e  31.07 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2245  ribosomal protein S24e  38.3 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1197  30S ribosomal protein S24e  36 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1895  30S ribosomal protein S24e  34.34 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0655  SSU ribosomal protein S24E  31.91 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.565102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0242  SSU ribosomal protein S24E  33.71 
 
 		 99 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0600  Ribosomal protein S24e  33.71 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0306  30S ribosomal protein S24e  31.91 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  28.16 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21323  predicted protein  28.09 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0004  ribosomal protein S24E-like protein  31.11 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2222  30S ribosomal protein S24e  22.58 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000329506 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09097  37S ribosomal protein S24 (AFU_orthologue; AFUA_7G02140)  30.38 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.133794  normal  0.364425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>