28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0956 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0956  flagella protein  100 
 
 
573 aa  1071    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.451324  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0234  flagella protein  61 
 
 
553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2872  Flagella accessory C family protein  51.13 
 
 
811 aa  120  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.899166  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1942  flagella protein  46.59 
 
 
162 aa  85.5  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2868  Flagella accessory C family protein  47.71 
 
 
482 aa  81.3  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.794531  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2564  Flagella accessory C family protein  66.67 
 
 
620 aa  78.2  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.840692  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0687  flagella protein  47.06 
 
 
165 aa  67.8  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.659141  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1570  flagella protein  31.09 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3416  Flagella accessory C family protein  38.2 
 
 
391 aa  59.7  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1246  flagella protein  36.49 
 
 
706 aa  53.9  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.774544  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1002  flagella protein  28.66 
 
 
321 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.793413  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0970  flagella protein  25.26 
 
 
337 aa  53.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1737  flagella protein  28.39 
 
 
304 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0943  flagella protein  30.69 
 
 
317 aa  50.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.921753  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0263  flagella protein  30.34 
 
 
136 aa  49.7  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106201  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0493  fla cluster protein FlaD  26.76 
 
 
165 aa  49.3  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.990936 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0143  flagella protein  30 
 
 
348 aa  48.9  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.626308  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0261  flagella accessory C family protein  32.26 
 
 
181 aa  47.8  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0653102  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0944  flagella protein  29 
 
 
135 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.45931  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3410  hypothetical protein  28.85 
 
 
152 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0262  flagella protein  29.17 
 
 
295 aa  46.6  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.377793  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1001  flagella protein  29 
 
 
135 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0969  flagella accessory C family protein  30.65 
 
 
187 aa  44.7  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0942  flagella accessory C family protein  30.65 
 
 
186 aa  44.7  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.559383  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0642  flagella protein  29.17 
 
 
114 aa  44.7  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1003  flagella accessory C family protein  30.65 
 
 
186 aa  44.3  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.495642  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1738  flagella accessory C family protein  27.06 
 
 
186 aa  44.3  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1736  flagella protein  27 
 
 
135 aa  44.3  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>