35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4265 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4265  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  908    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.045316  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5326  hypothetical protein  44.55 
 
 
224 aa  169  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3964  hypothetical protein  47.91 
 
 
212 aa  153  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1080  hypothetical protein  42.38 
 
 
217 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1107  hypothetical protein  42.38 
 
 
217 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439304  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1096  hypothetical protein  42.38 
 
 
217 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434425  normal  0.267536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1373  hypothetical protein  40.62 
 
 
237 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1376  hypothetical protein  41.67 
 
 
209 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4381  hypothetical protein  41.9 
 
 
215 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5001  hypothetical protein  43.22 
 
 
238 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4772  hypothetical protein  38.94 
 
 
205 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.880789  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1099  hypothetical protein  41.75 
 
 
225 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1082  hypothetical protein  41.75 
 
 
225 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00353882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1110  hypothetical protein  41.75 
 
 
225 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21410  hypothetical protein  40.49 
 
 
240 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787281  normal  0.739491 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3495  hypothetical protein  38.35 
 
 
222 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.969795  normal  0.604812 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1053  hypothetical protein  37.8 
 
 
234 aa  116  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.876186  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2486  hypothetical protein  33.67 
 
 
192 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0273408 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2964  hypothetical protein  32.11 
 
 
190 aa  83.2  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06980  hypothetical protein  26.79 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.316809  normal  0.0886062 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0544  hypothetical protein  29.47 
 
 
185 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5306  hypothetical protein  32.53 
 
 
197 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.012971  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1063  hypothetical protein  27.86 
 
 
188 aa  65.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0325013  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2655  hypothetical protein  26.4 
 
 
213 aa  63.9  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00248341  unclonable  0.0000000268429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3915  hypothetical protein  39.29 
 
 
185 aa  63.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.366535  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1709  hypothetical protein  27.5 
 
 
196 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0426  hypothetical protein  29.63 
 
 
191 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125949  hitchhiker  0.0000334915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0233  hypothetical protein  30.72 
 
 
197 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4760  hypothetical protein  29.52 
 
 
219 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.785775  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0328  hypothetical protein  25.64 
 
 
289 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227086  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2933  hypothetical protein  27.96 
 
 
181 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424917  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4850  hypothetical protein  27.11 
 
 
197 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5419  hypothetical protein  27.11 
 
 
197 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257905  normal  0.0113948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5443  hypothetical protein  27.11 
 
 
197 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0165  hypothetical protein  29.15 
 
 
185 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>