12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3416 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3416  Flagella accessory C family protein  100 
 
 
391 aa  769    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1570  flagella protein  24.14 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0143  flagella protein  22.58 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.626308  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0956  flagella protein  38.2 
 
 
573 aa  60.1  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.451324  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2564  Flagella accessory C family protein  34.78 
 
 
620 aa  57  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.840692  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1942  flagella protein  36.26 
 
 
162 aa  56.6  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0687  flagella protein  44.9 
 
 
165 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.659141  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0234  flagella protein  36.36 
 
 
553 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2868  Flagella accessory C family protein  30.77 
 
 
482 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.794531  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2872  Flagella accessory C family protein  28.18 
 
 
811 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.899166  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0493  fla cluster protein FlaD  35.62 
 
 
165 aa  44.3  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.990936 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1246  flagella protein  30.26 
 
 
706 aa  43.1  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.774544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>