19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3295 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3295  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  389  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5604  hypothetical protein  51.33 
 
 
173 aa  144  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0168557  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1132  hypothetical protein  46.75 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0544737  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0447  hypothetical protein  38.6 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2398  hypothetical protein  42.26 
 
 
168 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000409685  decreased coverage  0.000121837 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2969  hypothetical protein  36.77 
 
 
157 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1749  hypothetical protein  38.55 
 
 
167 aa  100  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.766751  hitchhiker  0.00905624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3893  hypothetical protein  35.37 
 
 
163 aa  94.4  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1389  hypothetical protein  37.25 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1228  hypothetical protein  32.88 
 
 
159 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.400134  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1033  hypothetical protein  29.53 
 
 
156 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3333  hypothetical protein  30.46 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1099  hypothetical protein  31.17 
 
 
159 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146092  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3036  hypothetical protein  31.87 
 
 
161 aa  52.4  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03295  conserved hypothetical protein  31.01 
 
 
315 aa  52.4  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0326172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5505  hypothetical protein  29.84 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.229484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3850  hypothetical protein  27.39 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0802919 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3177  hypothetical protein  51.02 
 
 
69 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18450  alpha-ketoglutarate decarboxylase  26.21 
 
 
1303 aa  41.2  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0618505  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>