26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3055 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3055  Ribosomal protein S24e  100 
 
 		 107 aa  212  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1271  Ribosomal protein S24e  92.47 
 
 		 106 aa  180  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2393  30S ribosomal protein S24e  75.73 
 
 		 102 aa  155  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  72.28 
 
 		 103 aa  147  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1171  Ribosomal protein S24e  76.34 
 
 		 101 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.538794  normal  0.934436 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  43.48 
 
 		 99 aa  85.9  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0282  30S ribosomal protein S24e  40.4 
 
 		 101 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2866  ribosomal protein S24e  35 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  38.38 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2283  30S ribosomal protein S24e  37.36 
 
 		 102 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000399836  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0468  30S ribosomal protein S24e  39.56 
 
 		 103 aa  67  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1440  30S ribosomal protein S24e  39.56 
 
 		 102 aa  67  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.17753 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1194  30S ribosomal protein S24e  40.66 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1428  30S ribosomal protein S24e  38.46 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1197  30S ribosomal protein S24e  39.08 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0655  SSU ribosomal protein S24E  30.93 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.565102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0242  SSU ribosomal protein S24E  35.96 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1895  30S ribosomal protein S24e  37.93 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0306  30S ribosomal protein S24e  37.93 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2245  ribosomal protein S24e  34 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1438  30S ribosomal protein S24e  39.51 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109359  normal  0.0262795 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0600  Ribosomal protein S24e  33.67 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0283  30S ribosomal protein S24e  33.65 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.568514  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  32.67 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0004  ribosomal protein S24E-like protein  31.11 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2222  30S ribosomal protein S24e  25 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000329506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>