13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2065 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2065  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  202  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1968  hypothetical protein  37.5 
 
 
92 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2131  hypothetical protein  34.52 
 
 
91 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4610  hypothetical protein  37.5 
 
 
90 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1705  hypothetical protein  35.71 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2091  hypothetical protein  32.95 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395312  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1930  hypothetical protein  37.35 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1074  hypothetical protein  38.55 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3283  hypothetical protein  50 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114531  normal  0.185458 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0894  hypothetical protein  31.03 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00183124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4336  hypothetical protein  32.18 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.022904  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5720  hypothetical protein  31.03 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.470242  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5212  hypothetical protein  34.88 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>