19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1704 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1704  Ribonuclease P  100 
 
 
234 aa  467  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3310  Ribonuclease P  74.89 
 
 
236 aa  356  1.9999999999999998e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2397  Ribonuclease P  63.56 
 
 
230 aa  292  3e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0526  Ribonuclease P  58.19 
 
 
235 aa  281  7.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277795  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0960  RNase P subunit p30  57.92 
 
 
240 aa  266  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0946359  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0194  ribonuclease P protein component 3  32.62 
 
 
241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00291251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2501  ribonuclease P protein component 3  34.03 
 
 
239 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0929909  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1367  RNase P subunit p30  30.04 
 
 
233 aa  95.9  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1415  ribonuclease P  27.48 
 
 
231 aa  85.9  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.586306  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1427  ribonuclease P  24.22 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal  0.570967 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0481  ribonuclease P  25.35 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1207  ribonuclease P  25.81 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1310  ribonuclease P  24.88 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.104784  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1680  RNase P subunit p30  28.84 
 
 
214 aa  61.6  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1824  RNase P/RNase MRP subunit p30-like protein  26.54 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.824867  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1343  hypothetical protein  25.25 
 
 
214 aa  49.3  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.116204  hitchhiker  0.00147591 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2280  RNase P/RNase MRP subunit p30-like  21.8 
 
 
213 aa  48.5  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2528  RNase P subunit p30  33.33 
 
 
212 aa  46.2  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.801364  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  25.18 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>