More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1393 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  100 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  83.2 
 
 		 251 aa  422  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0593  exsB protein  79.82 
 
 		 271 aa  384  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.564873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  77.63 
 
 		 229 aa  380  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  54.59 
 
 		 220 aa  265  7e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  56.62 
 
 		 222 aa  263  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  53.18 
 
 		 221 aa  257  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  52.23 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0784  exsB protein  52.23 
 
 		 226 aa  255  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00221024  normal  0.124073 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0838  exsB protein  49.35 
 
 		 258 aa  251  6e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34404  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0681  exsB protein  52.23 
 
 		 226 aa  248  7e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.998176  normal  0.357336 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1618  hypothetical protein  51.13 
 
 		 222 aa  247  1e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0543  ExsB  51.79 
 
 		 227 aa  246  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.153195  normal  0.601328 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0499  exsB protein  50.45 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00135935  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1313  ExsB  48.84 
 
 		 218 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0744  ExsB protein  42.66 
 
 		 220 aa  209  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4644  ExsB  45.93 
 
 		 257 aa  209  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0104  ExsB protein  43.84 
 
 		 223 aa  206  3e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.132302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  46.26 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0448  ExsB protein  43.64 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1070  ExsB  42.92 
 
 		 224 aa  198  6e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  45.81 
 
 		 227 aa  197  9e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  45.26 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0728  transcriptional regulator, ExsB family  39.73 
 
 		 221 aa  193  3e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000232803  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0016  ExsB  40 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.877177  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0016  exsB protein  40 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.981241  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0043  exsB protein  40 
 
 		 224 aa  189  5e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.228871  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  42.67 
 
 		 222 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  42.04 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  43.69 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  45.13 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  43.56 
 
 		 224 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  45.13 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  44.05 
 
 		 226 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  43.81 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  40.89 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  41.85 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  43.23 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  41.2 
 
 		 225 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  42.29 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  41.2 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  42.29 
 
 		 225 aa  178  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  40.09 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1538  ExsB protein  37.1 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.529687  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  42.59 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  40.09 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  43.3 
 
 		 223 aa  175  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  42.67 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  42.67 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  43.95 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  40.95 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  41.33 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  41.96 
 
 		 225 aa  172  5.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  42.92 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  42.92 
 
 		 228 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  42.48 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  41.38 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  42.73 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  42.48 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  42.41 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  42.48 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  43.97 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  41.07 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  42.86 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  41.33 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  42.48 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  43.97 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  44.1 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  43.97 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  42.92 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  41.67 
 
 		 230 aa  167  9e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  39.74 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  38.6 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  42.48 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  41.15 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  38.6 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0191  exsB protein  37.95 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000696721  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  40.87 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  41.13 
 
 		 229 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  39.06 
 
 		 230 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  40 
 
 		 259 aa  165  8e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  41.85 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  41.41 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  40 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  35.56 
 
 		 484 aa  163  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  41.48 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  39.09 
 
 		 226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  36.4 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  39.38 
 
 		 228 aa  162  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  39.65 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  41.33 
 
 		 237 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  41.96 
 
 		 236 aa  161  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  39.13 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  40.27 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  40.44 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01572  ExsB protein  42.22 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.779183  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2202  ExsB ATPase  44.05 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000761719 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1099  exsB protein  38.36 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  39.56 
 
 		 226 aa  159  5e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>