13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5535 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5535  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  631  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2150  hypothetical protein  39.02 
 
 
298 aa  182  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
639 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2561  hypothetical protein  32.32 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.19132 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0770  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 
266 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2456  Methyltransferase type 12  36.71 
 
 
317 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.938654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4661  hypothetical protein  36.25 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.075138  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2313  hypothetical protein  31.47 
 
 
285 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0708907  normal  0.275346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2748  hypothetical protein  31.79 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4786  hypothetical protein  35.82 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.263713 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2001  hypothetical protein  28.71 
 
 
283 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0544362  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1175  hypothetical protein  27.06 
 
 
288 aa  59.3  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.970469  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0515  hypothetical protein  26.77 
 
 
357 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0303682  normal  0.846131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>