10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5462 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5462  hypothetical protein  100 
 
 		 1236 aa  2454    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.434669  normal  0.334821 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2894  cellulose binding, type IV  25.5 
 
 		 1029 aa  106  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0297101 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02268  hypothetical protein  23.63 
 
 		 781 aa  106  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2714  hypothetical protein  27.15 
 
 		 783 aa  94  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2050  membrane protein  23.06 
 
 		 786 aa  86.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.200879  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0109  hypothetical protein  20.34 
 
 		 409 aa  74.3  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0329  hypothetical protein  22.96 
 
 		 345 aa  54.3  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2781  hypothetical protein  28.92 
 
 		 348 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293362  normal  0.0203975 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0142  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1016 aa  49.7  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.335318  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0850  hypothetical protein  26.36 
 
 		 450 aa  46.2  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.743665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>