20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5326 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5326  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  454  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4265  hypothetical protein  44.55 
 
 
455 aa  169  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.045316  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3964  hypothetical protein  44.44 
 
 
212 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1373  hypothetical protein  39.08 
 
 
237 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4381  hypothetical protein  42.41 
 
 
215 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1096  hypothetical protein  42.56 
 
 
217 aa  121  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434425  normal  0.267536 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1107  hypothetical protein  42.56 
 
 
217 aa  121  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439304  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1080  hypothetical protein  42.56 
 
 
217 aa  121  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227906  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21410  hypothetical protein  40 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787281  normal  0.739491 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1376  hypothetical protein  40.41 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5001  hypothetical protein  37.86 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3495  hypothetical protein  40.7 
 
 
222 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.969795  normal  0.604812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4772  hypothetical protein  39.15 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.880789  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1099  hypothetical protein  35.45 
 
 
225 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1082  hypothetical protein  35.45 
 
 
225 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00353882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1110  hypothetical protein  35.45 
 
 
225 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1053  hypothetical protein  33.18 
 
 
234 aa  85.1  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.876186  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3915  hypothetical protein  29.79 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.366535  normal  0.0366179 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06980  hypothetical protein  32.56 
 
 
354 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.316809  normal  0.0886062 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2933  hypothetical protein  30.73 
 
 
181 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424917  normal  0.432294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>