51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4089 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4089  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  556  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.0383988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2547  hypothetical protein  53.07 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2644  hypothetical protein  51.32 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0827849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2738  hypothetical protein  51.32 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.305966  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1222  hypothetical protein  51.74 
 
 		 256 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.371276  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2794  hypothetical protein  32.74 
 
 		 937 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.749604  normal  0.246775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2904  hypothetical protein  34.54 
 
 		 924 aa  99  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.365436 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0205  hypothetical protein  34.12 
 
 		 921 aa  99  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.556354 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0723  hypothetical protein  32.77 
 
 		 914 aa  97.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2769  double-transmembrane region-like  33.88 
 
 		 929 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.676495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1022  hypothetical protein  36.28 
 
 		 925 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.52068  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2683  hypothetical protein  37.09 
 
 		 925 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.574694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3058  hypothetical protein  31.84 
 
 		 937 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0693886 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2181  hypothetical protein  33.18 
 
 		 942 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0685  double-transmembrane region-like  34.7 
 
 		 919 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.621898  normal  0.74897 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2277  hypothetical protein  32.54 
 
 		 937 aa  89.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30304  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3232  hypothetical protein  29.39 
 
 		 942 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.708508  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2842  hypothetical protein  34.36 
 
 		 939 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2232  hypothetical protein  32.49 
 
 		 939 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4482  hypothetical protein  32.88 
 
 		 941 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.792341  hitchhiker  0.00755842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0371  double-transmembrane region-like  36.42 
 
 		 927 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.601757  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2946  hypothetical protein  31.25 
 
 		 943 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575307  normal  0.59944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5169  hypothetical protein  32.43 
 
 		 939 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.165999  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2628  double-transmembrane region  30.97 
 
 		 937 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3253  double-transmembrane region-like  31.45 
 
 		 938 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.331442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2269  hypothetical protein  29.69 
 
 		 940 aa  82.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.501234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3637  hypothetical protein  32.02 
 
 		 939 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504486  normal  0.363104 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1293  double-transmembrane region-like  28.23 
 
 		 941 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.397525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1190  double-transmembrane region-like  29.2 
 
 		 941 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1374  hypothetical protein  30.13 
 
 		 941 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347989  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1506  hypothetical protein  29.39 
 
 		 948 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.446295  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1558  hypothetical protein  29.39 
 
 		 949 aa  80.5  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1454  hypothetical protein  31.86 
 
 		 943 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332859  normal  0.622098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0914  double-transmembrane region-like  30.24 
 
 		 958 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1457  hypothetical protein  30.94 
 
 		 945 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.109883 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3904  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0103239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1734  hypothetical protein  30.94 
 
 		 945 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.093784 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3011  hypothetical protein  36.81 
 
 		 940 aa  79  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0470546  normal  0.329062 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1607  hypothetical protein  30.36 
 
 		 957 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557026  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2005  hypothetical protein  31.43 
 
 		 892 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1009  hypothetical protein  27.6 
 
 		 932 aa  70.5  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.479574  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0306  A-macroglobulin complement component  29.22 
 
 		 827 aa  69.7  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3492  twin-arginine translocation pathway signal  21.86 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1325  hypothetical protein  24.64 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125239  normal  0.126591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2095  hypothetical protein  23.96 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.519948  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0088  hypothetical protein  27.8 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235222  normal  0.0227484 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0129  hypothetical protein  30 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4595  hypothetical protein  23.12 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.6728  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4064  hypothetical protein  27.14 
 
 		 218 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0450  hypothetical protein  24.46 
 
 		 220 aa  52.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1353  hypothetical protein  25.7 
 
 		 219 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.187425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>