22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3102 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  100 
 
 		 466 aa  913    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.220551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  41.49 
 
 		 491 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0555  Lanthionine synthetase C family protein  27.25 
 
 		 409 aa  143  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  28.18 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4705  Lanthionine synthetase C family protein  26.15 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4693  Lanthionine synthetase C family protein  28.9 
 
 		 385 aa  87  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  29.59 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3397  Lanthionine synthetase C family protein  23.78 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  31.25 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  27.11 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0603  lanthionine synthetase C family protein  26.54 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3937  Lanthionine synthetase C family protein  27.85 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207083  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2032  hypothetical protein  30.83 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6754  lanthionine synthetase C family protein  32.88 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  30.79 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5418  Lanthionine synthetase C family protein  30.41 
 
 		 409 aa  57  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4648  Lanthionine synthetase C family protein  31.8 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3603  Lanthionine synthetase C family protein  26.22 
 
 		 409 aa  54.3  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2800  lanthionine synthetase C family protein  33.47 
 
 		 399 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0205  hypothetical protein  29.39 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3997  hypothetical protein  35.14 
 
 		 242 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3531  hypothetical protein  34.78 
 
 		 427 aa  43.5  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0966276  normal  0.218294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>