30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2132 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2132  protein of unknown function DUF1022  100 
 
 
334 aa  687    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0478  protein of unknown function DUF1022  53.18 
 
 
328 aa  344  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327326  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1980  hypothetical protein  41.36 
 
 
334 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2310  hypothetical protein  36.45 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.488109  hitchhiker  0.00181536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4294  hypothetical protein  34.25 
 
 
456 aa  188  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.954414 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2684  hypothetical protein  35.58 
 
 
339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.219268  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1025  protein of unknown function DUF1022  33.74 
 
 
361 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.607672  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0564  hypothetical protein  34.5 
 
 
349 aa  172  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0155833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1091  hypothetical protein  32.21 
 
 
369 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.713738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1220  protein of unknown function DUF1022  32.21 
 
 
374 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3359  protein of unknown function DUF1022  35.2 
 
 
323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.014075  normal  0.714541 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2143  hypothetical protein  31.52 
 
 
318 aa  145  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5826  protein of unknown function DUF1022  32.92 
 
 
342 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2753  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  33.33 
 
 
380 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5023  hypothetical protein  29.55 
 
 
323 aa  132  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63499  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3794  hypothetical protein  31.58 
 
 
324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0357  protein of unknown function DUF1022  31.4 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2765  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  31.32 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.368622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03908  hypothetical protein  32.61 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1127  hypothetical protein  29.48 
 
 
319 aa  109  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.330944  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1093  hypothetical protein  30.91 
 
 
319 aa  110  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44420  hypothetical protein  28.3 
 
 
779 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3079  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  27.17 
 
 
359 aa  89.7  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.674528 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0559  hypothetical protein  27.43 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.993865  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1867  hypothetical protein  28.31 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1277  protein of unknown function DUF1022  27.4 
 
 
395 aa  63.2  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000300037  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0476  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like protein  25.09 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3765  protein of unknown function DUF1022  26.11 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3771  protein of unknown function DUF1022  32.46 
 
 
331 aa  50.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0441  hypothetical protein  26.92 
 
 
307 aa  45.8  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00694854  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>