33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1743 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1743  putative lipoprotein B precursor  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0430569  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  29.56 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2278  rare lipoprotein B  28.28 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  27.1 
 
 		 168 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  26.8 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  25.69 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2572  Rare lipoprotein B  28.57 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136179  normal  0.613264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2982  Rare lipoprotein B  29.25 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  28.97 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2743  putative lipoprotein B precursor transmembrane  27.59 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  23.9 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0233  rare lipoprotein B precursor  24.26 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0255  rare lipoprotein B precursor  25.15 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  25.52 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6002  rare lipoprotein B  25 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  26.11 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  26.67 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  26.21 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2131  Rare lipoprotein B  24.83 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.1085 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  27.59 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  27.1 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  25 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  30.08 
 
 		 167 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  20 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  20 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  26.8 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0759  rare lipoprotein B  22.76 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  24.67 
 
 		 164 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2144  rare lipoprotein B  28.89 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0401  rare lipoprotein B-like protein  25 
 
 		 179 aa  42  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2745  rare lipoprotein B  25.69 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3785  rare lipoprotein B  21.48 
 
 		 171 aa  41.6  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  23.68 
 
 		 201 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>