87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0658 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  100 
 
 
179 aa  352  1e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  42.01 
 
 
169 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1367  hypothetical protein  41.71 
 
 
174 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  42.5 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  39.08 
 
 
176 aa  128  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  37.71 
 
 
208 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  37.28 
 
 
175 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  38.15 
 
 
175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  39.74 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  39.74 
 
 
210 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  39.74 
 
 
177 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2390  hypothetical protein  36.69 
 
 
169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.194438  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1768  hypothetical protein  38.69 
 
 
168 aa  124  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.254976  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  44.76 
 
 
186 aa  124  9e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  36.69 
 
 
174 aa  121  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  36.05 
 
 
172 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  36.87 
 
 
179 aa  121  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  37.21 
 
 
169 aa  120  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2586  hypothetical protein  36.69 
 
 
169 aa  120  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.757893  normal  0.0816334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  36.59 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  36.47 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2494  hypothetical protein  36.09 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.101154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2424  hypothetical protein  36.09 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.433268  normal  0.183637 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  37.13 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1703  hypothetical protein  34.91 
 
 
169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176608  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1666  hypothetical protein  34.91 
 
 
169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.257609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2676  hypothetical protein  34.91 
 
 
169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1681  hypothetical protein  34.91 
 
 
169 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1778  hypothetical protein  35.09 
 
 
180 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.728961  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2828  hypothetical protein  40.49 
 
 
159 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1555  hypothetical protein  33.73 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  38.36 
 
 
196 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  34.91 
 
 
169 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  38.41 
 
 
163 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  33.14 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  36.47 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2507  hypothetical protein  42.61 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.792495  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  36.53 
 
 
212 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1636  hypothetical protein  33.93 
 
 
168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.687372  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  36.47 
 
 
169 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1989  hypothetical protein  41.46 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  36.81 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  36.47 
 
 
180 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  32.95 
 
 
171 aa  103  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2671  hypothetical protein  38.75 
 
 
178 aa  99  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  35.8 
 
 
177 aa  98.6  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2833  hypothetical protein  38.76 
 
 
182 aa  98.2  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0982426  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  33.96 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0784  hypothetical protein  30.65 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11051  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0790  hypothetical protein  30.94 
 
 
197 aa  92  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0872806  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0609  hypothetical protein  32.95 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1383  hypothetical protein  36.2 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0318  hypothetical protein  34.39 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1643  Protein of unknown function DUF2062  31.25 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  33.53 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  35.29 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  34.27 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0557  hypothetical protein  31.25 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.235942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1214  hypothetical protein  32.3 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4460  hypothetical protein  30.23 
 
 
192 aa  61.2  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0643  hypothetical protein  30.77 
 
 
186 aa  60.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0482  hypothetical protein  30.77 
 
 
186 aa  60.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  31.58 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  33.99 
 
 
377 aa  50.8  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  28.89 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  31.62 
 
 
228 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  30.08 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  28.7 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  28.89 
 
 
160 aa  48.5  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  28.15 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3294  hypothetical protein  28.19 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.943309  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1445  hypothetical protein  36.47 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  28.36 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  28.22 
 
 
397 aa  45.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  27.93 
 
 
187 aa  45.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  31.67 
 
 
190 aa  44.7  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  31.67 
 
 
190 aa  44.7  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  26.39 
 
 
171 aa  44.7  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  29.73 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  26.96 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  28.83 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  28.89 
 
 
160 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  26.96 
 
 
147 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  31.9 
 
 
162 aa  42.7  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  38.1 
 
 
146 aa  41.6  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1826  hypothetical protein  29.14 
 
 
187 aa  41.6  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433146  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  40.8  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>