13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0232 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0232  flagellin  100 
 
 
150 aa  295  1e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0958  flagellin  60.93 
 
 
149 aa  170  5.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2566  flagellin  43.48 
 
 
165 aa  124  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.577565  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3414  flagellin  42.38 
 
 
153 aa  103  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2867  flagellin  38.16 
 
 
161 aa  92.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.543468  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1572  putative flagellar protein G  33.33 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1320  flagellin  32.19 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.116109  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0946  flagellar protein G  31.65 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147708  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0999  flagellar protein G  31.43 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.90055  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1734  flagellar protein G  29.29 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3558  flagellin  27.63 
 
 
252 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0265  flagellar protein G  27.86 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.186357  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0973  flagella protein G  30.93 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>