13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3260 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_3260  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  417  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0865  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 
205 aa  199  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2881  putative transcriptional regulator  36.9 
 
 
186 aa  117  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3685  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 
169 aa  115  6e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0125  hypothetical protein  29.09 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3918  hypothetical protein  32.1 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.825288  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4597  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  62.4  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.794449  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1138  putative transcriptional regulator  32.19 
 
 
172 aa  59.7  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331143  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1482  hypothetical protein  27.65 
 
 
173 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2988  hypothetical protein  29.92 
 
 
179 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.615275  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0124  hypothetical protein  27.52 
 
 
188 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0115344  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2884  hypothetical protein  26.09 
 
 
183 aa  45.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3226  putative transcriptional regulator  27.81 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>