10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2882 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_2882  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  306  5.9999999999999995e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4207  hypothetical protein  87.95 
 
 
134 aa  157  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3259  hypothetical protein  46.94 
 
 
161 aa  120  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0866  hypothetical protein  42.28 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3684  hypothetical protein  42.36 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4598  hypothetical protein  45.71 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.696771  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3919  hypothetical protein  35.45 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1483  hypothetical protein  34.86 
 
 
150 aa  47.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2764  hypothetical protein  36.14 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0123  hypothetical protein  42.11 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0228855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>