14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2672 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2672  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  188  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0946791  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3226  hypothetical protein  44.59 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4895  hypothetical protein  37.36 
 
 
104 aa  52.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.904597  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1196  hypothetical protein  41.1 
 
 
98 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4576  hypothetical protein  34.44 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1041  hypothetical protein  37.21 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1950  hypothetical protein  35.16 
 
 
104 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4765  hypothetical protein  37.65 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4943  hypothetical protein  35.14 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.475224  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1848  hypothetical protein  41.54 
 
 
100 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4233  hypothetical protein  41.03 
 
 
80 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2915  hypothetical protein  34.57 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2203  hypothetical protein  40.58 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382258  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1333  hypothetical protein  34.07 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>