12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2626 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2626  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  294  3e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.817414 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0322  conserved hypothetical membrane spanning protein  51.9 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1125  hypothetical protein  46.2 
 
 
157 aa  123  9e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.310685  normal  0.848341 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1934  hypothetical protein  40.51 
 
 
157 aa  100  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3229  hypothetical protein  38.95 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.417669  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0906  hypothetical protein  35.29 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.25027  normal  0.869018 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1333  histidine kinase  38.38 
 
 
515 aa  60.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.319012  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4079  conserved hypothetical membrane spanning protein  38.46 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175719  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2153  hypothetical protein  33.56 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0929  histidine kinase  37.86 
 
 
564 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2796  hypothetical protein  33.91 
 
 
177 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4667  hypothetical protein  36.9 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.419018  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>