12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2566 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2566  flagellin  100 
 
 
165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.577565  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0958  flagellin  47.17 
 
 
149 aa  137  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0232  flagellin  43.48 
 
 
150 aa  124  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3414  flagellin  40.74 
 
 
153 aa  107  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1572  putative flagellar protein G  36.02 
 
 
167 aa  95.5  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2867  flagellin  34.13 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.543468  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1320  flagellin  33.12 
 
 
140 aa  59.7  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.116109  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3558  flagellin  28.12 
 
 
252 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0946  flagellar protein G  30.53 
 
 
150 aa  52  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147708  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0999  flagellar protein G  30.53 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.90055  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1734  flagellar protein G  28.24 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0973  flagella protein G  29.92 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.402634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>