24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2393 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2393  30S ribosomal protein S24e  100 
 
 		 102 aa  205  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1171  Ribosomal protein S24e  73.53 
 
 		 101 aa  150  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.538794  normal  0.934436 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3055  Ribosomal protein S24e  78.26 
 
 		 107 aa  150  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1956  30S ribosomal protein S24e  72.82 
 
 		 103 aa  148  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1271  Ribosomal protein S24e  75 
 
 		 106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0282  30S ribosomal protein S24e  44.12 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0565  Ribosomal protein S24e  41.3 
 
 		 99 aa  84  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2283  30S ribosomal protein S24e  40.66 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000399836  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1428  30S ribosomal protein S24e  40.66 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1324  ribosomal protein S24e  40 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0468  30S ribosomal protein S24e  39.56 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1440  30S ribosomal protein S24e  39.56 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.17753 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2866  ribosomal protein S24e  38.83 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0232218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1194  30S ribosomal protein S24e  38.46 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2245  ribosomal protein S24e  37.76 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0655  SSU ribosomal protein S24E  30.69 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.565102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0600  Ribosomal protein S24e  35.29 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.577491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0283  30S ribosomal protein S24e  29.67 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.568514  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0242  SSU ribosomal protein S24E  34.83 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1197  30S ribosomal protein S24e  38 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1895  30S ribosomal protein S24e  33.33 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0306  30S ribosomal protein S24e  33.33 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1438  30S ribosomal protein S24e  29.89 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109359  normal  0.0262795 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0448  ribosomal protein S24e  28.43 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>