13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1933 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1933  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  366  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.236478  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2763  hypothetical protein  61.2 
 
 
193 aa  203  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226787  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1737  hypothetical protein  68.57 
 
 
196 aa  186  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.493809 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0402  hypothetical protein  62.84 
 
 
192 aa  185  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2046  hypothetical protein  65.14 
 
 
193 aa  158  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0293  hypothetical protein  38.33 
 
 
211 aa  125  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1034  hypothetical protein  35.56 
 
 
207 aa  115  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.712224  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0655  hypothetical protein  32.98 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.585602  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1611  hypothetical protein  25.79 
 
 
195 aa  67.8  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0567857  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1262  hypothetical protein  26.92 
 
 
213 aa  62.8  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0069  hypothetical protein  24.86 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.465201  normal  0.0755132 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1053  hypothetical protein  25.66 
 
 
210 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0317482  normal  0.124419 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2134  hypothetical protein  24.61 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>