12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1928 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1928  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  194  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109081  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4117  hypothetical protein  31.82 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.454332  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4507  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4076  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5173  hypothetical protein  41.46 
 
 
167 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4616  hypothetical protein  43.4 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3004  hypothetical protein  42.86 
 
 
167 aa  45.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382258  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4144  hypothetical protein  35.62 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1982  hypothetical protein  43.59 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0547  hypothetical protein  33.7 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.782516  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0845  hypothetical protein  41.67 
 
 
215 aa  41.2  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0584  hypothetical protein  38.46 
 
 
125 aa  40.4  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>