15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0493 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0493  fla cluster protein FlaD  100 
 
 		 165 aa  328  3e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.990936 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1942  flagella protein  29.65 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0687  flagella protein  31.4 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.659141  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2868  Flagella accessory C family protein  34.29 
 
 		 482 aa  54.3  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.794531  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0956  flagella protein  26.76 
 
 		 573 aa  50.8  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.451324  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1246  flagella protein  26.75 
 
 		 706 aa  47.4  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.774544  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2872  Flagella accessory C family protein  34.38 
 
 		 811 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.899166  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0263  flagella protein  32.14 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106201  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0234  flagella protein  27.17 
 
 		 553 aa  45.1  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3416  Flagella accessory C family protein  34.67 
 
 		 391 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0971  flagella protein  33.33 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.818854  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1736  flagella protein  32.18 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0944  flagella protein  33.33 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.45931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1001  flagella protein  33.33 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2564  Flagella accessory C family protein  38.96 
 
 		 620 aa  40.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.840692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>