13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0275 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0275  ATP synthase H subunit  100 
 
 		 118 aa  204  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3347  ATP synthase H subunit  56.36 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1377  ATP synthase H subunit  52.73 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1275  ATP synthase H subunit  51.82 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.697583 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1216  hypothetical protein  34.26 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000352067  normal  0.219471 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0392  H(+)-transporting ATP synthase, subunit H  33.96 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1431  ATP synthase H subunit  58.18 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.600766  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1615  H(+)-transporting ATP synthase, subunit H  31.37 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211075  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1237  H(+)-transporting ATP synthase, subunit H  32.71 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  44.12 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1177  V-type H+-transporting ATPase subunit E  32.65 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0568319  normal  0.870937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2351  V-type H+-transporting ATPase subunit E  27.62 
 
 		 109 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399869 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0281  V-type H+-transporting ATPase subunit E  29.63 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.026462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>