19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1578 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1578  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3048  hypothetical protein  50.82 
 
 
66 aa  60.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2086  hypothetical protein  44.26 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.348826  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0446  hypothetical protein  48.21 
 
 
63 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00904769  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1424  hypothetical protein  40.98 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0316  hypothetical protein  43.33 
 
 
59 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2966  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  44.83 
 
 
64 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0265  hypothetical protein  48 
 
 
55 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0107016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0166  hypothetical protein  42.19 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3999  hypothetical protein  40 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3711  hypothetical protein  41.07 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3025  hypothetical protein  46.15 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2847  hypothetical protein  38.46 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2740  hypothetical protein  38.46 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2499  hypothetical protein  52 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2672  hypothetical protein  38.46 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2258  hypothetical protein  39.62 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1033  transport-associated  35.48 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.232129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0308  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  41.07 
 
 
63 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>