20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1062 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1062  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  899    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2583  hypothetical protein  33.72 
 
 		 463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1514  hypothetical protein  26.84 
 
 		 476 aa  133  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.721483  normal  0.922529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0138  hypothetical protein  25.83 
 
 		 469 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000720067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2733  hypothetical protein  24.62 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2788  hypothetical protein  25.32 
 
 		 484 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0973  hypothetical protein  27.67 
 
 		 485 aa  113  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.442051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3318  hypothetical protein  27 
 
 		 467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1929  hypothetical protein  23.32 
 
 		 510 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.696713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1763  hypothetical protein  24.58 
 
 		 501 aa  101  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3680  hypothetical protein  23.24 
 
 		 506 aa  95.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1912  hypothetical protein  23.34 
 
 		 484 aa  92  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398652  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2711  hypothetical protein  24.03 
 
 		 474 aa  86.7  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0676  hypothetical protein  23.63 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2690  hypothetical protein  24.81 
 
 		 498 aa  71.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0011  hypothetical protein  22.87 
 
 		 493 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0217  hypothetical protein  21.64 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0471  hypothetical protein  31.18 
 
 		 373 aa  48.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1113  hypothetical protein  25 
 
 		 392 aa  47  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1017  hypothetical protein  24.22 
 
 		 392 aa  43.9  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>