More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0585 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 		 494 aa  1012    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0765  signal transduction histidine kinase  74.59 
 
 		 495 aa  772    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0891628  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08440  signal transduction histidine kinase  46 
 
 		 492 aa  418  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.367535  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  44.69 
 
 		 493 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  44.47 
 
 		 492 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  44.58 
 
 		 484 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2829  signal transduction histidine kinase  43.83 
 
 		 517 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2698  signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 489 aa  354  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2429  signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 490 aa  354  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180787 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 		 503 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 500 aa  334  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 		 497 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 497 aa  324  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0559  signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 		 490 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7712  signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 509 aa  316  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0555  signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 		 521 aa  316  7e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 		 514 aa  312  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5177  signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 492 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.245991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  38.2 
 
 		 491 aa  301  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 487 aa  296  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 520 aa  296  6e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1411  signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 500 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.597292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 496 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 511 aa  286  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 496 aa  286  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3522  histidine kinase dimerization/phosphoacceptor  36.71 
 
 		 500 aa  282  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14630  signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 502 aa  278  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13246  two component sensor kinase  37.13 
 
 		 501 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.467519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4087  signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 508 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0238732  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6290  signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 		 492 aa  269  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 496 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 496 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 512 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 496 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3706  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  36.42 
 
 		 516 aa  264  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 		 494 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08780  signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 480 aa  231  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102396  normal  0.0847778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0352  signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 475 aa  223  4e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 465 aa  145  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 492 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  25.21 
 
 		 475 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 834 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 613 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1075  signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 478 aa  113  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 532 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 215 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 3706 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 547 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2024  signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 497 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 991 aa  105  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 551 aa  104  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 1253 aa  104  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 674 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 932 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  31.33 
 
 		 918 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 631 aa  101  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 945 aa  99.8  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 732 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5382  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 511 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 1676 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  36.6 
 
 		 344 aa  99.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  31.46 
 
 		 1210 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 681 aa  98.6  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 349 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.63 
 
 		 348 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2857  signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 515 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.114386 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 1560 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 348 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  32.99 
 
 		 744 aa  98.6  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 767 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  31.96 
 
 		 1239 aa  97.1  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 1047 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 662 aa  96.3  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 964 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 616 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2296  signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 541 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0982064  normal  0.378772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 1246 aa  95.1  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  30.21 
 
 		 754 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1093 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  31.27 
 
 		 1182 aa  94  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 347 aa  94  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 462 aa  93.6  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 1714 aa  93.2  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  31.97 
 
 		 657 aa  93.2  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1249  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 460 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 1051 aa  92.8  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 585 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4451  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 647 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0783644  hitchhiker  0.000419686 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1483  sensory transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 704 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.681498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 348 aa  92  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 872 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 387 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 871 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 356 aa  90.9  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 864 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.53 
 
 		 783 aa  90.9  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 1654 aa  90.5  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 526 aa  90.5  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>