15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3890 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3890  hypothetical protein  100 
 
 
55 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.412324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1724  hypothetical protein  70.73 
 
 
51 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00225756  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3069  hypothetical protein  54.05 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0139073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1439  hypothetical protein  48.72 
 
 
47 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1511  hypothetical protein  48.72 
 
 
47 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000959495 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1142  hypothetical protein  48.72 
 
 
47 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.574683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1343  hypothetical protein  46.15 
 
 
47 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.744484  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1543  hypothetical protein  46.15 
 
 
47 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1581  hypothetical protein  46.15 
 
 
47 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0767219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1475  hypothetical protein  46.15 
 
 
47 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3869  hypothetical protein  46.15 
 
 
47 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0263705 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2783  hypothetical protein  50 
 
 
53 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000090627  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1707  hypothetical protein  48.94 
 
 
57 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1352  hypothetical protein  56.25 
 
 
75 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000793616  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1978  hypothetical protein  41.38 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000250196  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>