13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3172 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3172  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  332  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4092  hypothetical protein  36.77 
 
 
159 aa  97.1  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.450733 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0503  hypothetical protein  40 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3516  hypothetical protein  30.12 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.296175  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0318  hypothetical protein  30.57 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2249  hypothetical protein  30.83 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000214178  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2318  hypothetical protein  40 
 
 
175 aa  67  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000218333  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1645  hypothetical protein  28.1 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2275  hypothetical protein  30.85 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2406  hypothetical protein  28.21 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2831  hypothetical protein  28.42 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3266  hypothetical protein  28.42 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.171623  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3358  hypothetical protein  24.8 
 
 
265 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>