13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1199 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1199  HEPN domain-containing protein  100 
 
 
131 aa  263  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535155  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0103  HEPN domain protein  39.69 
 
 
134 aa  88.6  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4033  HEPN domain protein  32.04 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1564  hypothetical protein  30.34 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.320963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2918  HEPN domain protein  34.52 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2849  HEPN domain protein  29.63 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.335938 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3071  hypothetical protein  25.58 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.536679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0499  HEPN domain-containing protein  28 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000701163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0525  HEPN domain-containing protein  22.69 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5275  HEPN domain protein  28.21 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.975164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4163  HEPN domain protein  34.52 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1393  hypothetical protein  25.56 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1657  hypothetical protein  30.95 
 
 
203 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.07572  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>