15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0799 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0799  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  279  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003212  hypothetical protein  40.91 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1278  hypothetical protein  43.94 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003298  hypothetical protein  37.4 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06435  hypothetical protein  37.12 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1907  hypothetical protein  35.34 
 
 
234 aa  84.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.469149  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0658  hypothetical protein  32.12 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.815459  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0026  hypothetical protein  37.8 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2430  hypothetical protein  54.55 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0813  hypothetical protein  30.5 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1018  hypothetical protein  44.44 
 
 
77 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.492619  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05385  hypothetical protein  31.91 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0650384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4334  hypothetical protein  41.54 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00241098  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4137  hypothetical protein  29.07 
 
 
205 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0700051  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0411  hypothetical protein  36.36 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0106882  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>