24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5081 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5081  glycoprotein  100 
 
 		 784 aa  1451    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0297012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7081  hypothetical protein  30.79 
 
 		 764 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39620  hypothetical protein  28.55 
 
 		 706 aa  170  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2141  hypothetical protein  30.14 
 
 		 820 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0602893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9371  hypothetical protein  29.76 
 
 		 713 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741382  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4966  hypothetical protein  27.42 
 
 		 706 aa  151  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3103  hypothetical protein  27.55 
 
 		 835 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7323  hypothetical protein  29.18 
 
 		 919 aa  122  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.815907 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3573  hypothetical protein  27.5 
 
 		 814 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.950608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4842  hypothetical protein  29.42 
 
 		 905 aa  103  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6063  hypothetical protein  41.61 
 
 		 811 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.405388  normal  0.16788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0843  hypothetical protein  40.94 
 
 		 804 aa  91.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.633938  normal  0.153165 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5775  hypothetical protein  41.18 
 
 		 809 aa  91.3  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.551065  normal  0.325529 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13944  hypothetical protein  40.72 
 
 		 802 aa  90.9  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00151105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5488  hypothetical protein  41.18 
 
 		 809 aa  90.9  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5399  hypothetical protein  41.18 
 
 		 809 aa  90.9  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3714  hypothetical protein  28.19 
 
 		 728 aa  90.1  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.499099  normal  0.0383844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5399  hypothetical protein  39.74 
 
 		 873 aa  87.8  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37910  hypothetical protein  27.82 
 
 		 751 aa  87.8  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4850  hypothetical protein  33.16 
 
 		 870 aa  83.2  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4532  hypothetical protein  26.16 
 
 		 884 aa  81.3  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.796948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4225  glycoprotein  35.11 
 
 		 831 aa  68.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553317  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31850  hypothetical protein  26.2 
 
 		 741 aa  54.7  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4209  hypothetical protein  26.29 
 
 		 703 aa  44.3  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>