33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3732 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3732  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  744    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07280  hypothetical protein  56.58 
 
 
362 aa  306  6e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.776305  normal  0.0453221 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3246  hypothetical protein  57.14 
 
 
338 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.678761  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0452  hypothetical protein  52 
 
 
353 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2726  hypothetical protein  44.38 
 
 
366 aa  253  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.534782  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0529  hypothetical protein  38.93 
 
 
376 aa  219  6e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308782  hitchhiker  0.00891626 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1286  hypothetical protein  36.57 
 
 
342 aa  172  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1702  secreted protein  39.59 
 
 
356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.417633  normal  0.0125499 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1400  secreted protein  35.43 
 
 
364 aa  149  8e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2104  hypothetical protein  36.17 
 
 
373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.243869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12530  hypothetical protein  29.9 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22930  hypothetical protein  37.18 
 
 
328 aa  133  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459753  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5211  hypothetical protein  35.74 
 
 
355 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2070  hypothetical protein  31.83 
 
 
334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.379784  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6122  hypothetical protein  32.99 
 
 
337 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2517  hypothetical protein  29.29 
 
 
355 aa  124  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2831  hypothetical protein  28.96 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3416  hypothetical protein  31.96 
 
 
359 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000117428  hitchhiker  0.0000237376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0640  PT repeat-containing protein  31.91 
 
 
390 aa  113  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2290  PT repeat-containing protein  33.11 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0125565 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1276  hypothetical protein  26.21 
 
 
356 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0173  hypothetical protein  31.99 
 
 
357 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.972629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2113  hypothetical protein  33.1 
 
 
331 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3047  hypothetical protein  32.89 
 
 
331 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070521  normal  0.601156 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1532  PT repeat-containing protein  31.19 
 
 
391 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.679674  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1143  hypothetical protein  27.03 
 
 
336 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  29.75 
 
 
613 aa  99.4  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0267  hypothetical protein  27.52 
 
 
315 aa  99.4  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0155  hypothetical protein  26.79 
 
 
353 aa  94.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22307  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0130  hypothetical protein  27.74 
 
 
373 aa  93.2  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2346  hypothetical protein  24.83 
 
 
397 aa  89.4  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00115323  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2608  hypothetical protein  23.03 
 
 
419 aa  89.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3134  PT repeat-containing protein  29.64 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>