28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3280 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3280  Sucraseferredoxin family protein  100 
 
 
313 aa  611  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3065  Sucraseferredoxin family protein  45.05 
 
 
308 aa  192  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000185478  hitchhiker  0.00205688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2908  Sucraseferredoxin family protein  43.8 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0338  sucraseferredoxin family protein  38.64 
 
 
300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248903  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5631  sucraseferredoxin family protein  39.25 
 
 
295 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5251  sucraseferredoxin-like protein  38.87 
 
 
295 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5340  sucraseferredoxin family protein  38.87 
 
 
295 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.901473  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4377  sucraseferredoxin family protein  39.44 
 
 
303 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0587956  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1340  Sucraseferredoxin family protein  42.39 
 
 
268 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421578  normal  0.474858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02490  uncharacterized conserved protein with thioredoxin-like domain  36.43 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2240  sucraseferredoxin family protein  37.74 
 
 
301 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.100946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5270  Sucraseferredoxin family protein  39.08 
 
 
314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4380  sucraseferredoxin family protein  39.48 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102429  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13820  uncharacterized conserved protein with thioredoxin-like domain  39.29 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.544506  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6685  hypothetical protein  37.56 
 
 
312 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108203  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1795  Sucraseferredoxin family protein  38.35 
 
 
312 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00301305  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0955  Sucraseferredoxin family protein  34.74 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.886609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1766  Sucraseferredoxin family protein  33.07 
 
 
334 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8095  Sucraseferredoxin family protein  38.92 
 
 
234 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3033  sucraseferredoxin-like  24.31 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.262955  hitchhiker  0.00219158 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1040  sucraseferredoxin-like protein  39.64 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2831  hypothetical protein  21.28 
 
 
331 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1568  sucraseferredoxin family protein  26.8 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4340  hypothetical protein  26.46 
 
 
325 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4480  sucraseferredoxin family protein  34.62 
 
 
269 aa  59.7  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5760  Sucraseferredoxin family protein  21.94 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2755  sucraseferredoxin-like  35.05 
 
 
299 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4698  sucraseferredoxin family protein  34.88 
 
 
333 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>