28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3040 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3040  Protein of unknown function DUF2581  100 
 
 
164 aa  315  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1874  hypothetical protein  42.47 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1881  hypothetical protein  43.75 
 
 
186 aa  107  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0884848  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3051  hypothetical protein  44.29 
 
 
152 aa  97.8  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11446  hypothetical protein  40.3 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0232943  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2392  hypothetical protein  42.24 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142934  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2439  hypothetical protein  42.24 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.164937 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2433  hypothetical protein  42.24 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.504419  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2696  hypothetical protein  38.81 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5216  hypothetical protein  39.29 
 
 
158 aa  79  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.025258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3717  hypothetical protein  40.54 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.668266  normal  0.103585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4149  hypothetical protein  39.04 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.638861  hitchhiker  0.00100829 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2357  Protein of unknown function DUF2581  39.42 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15750  Protein of unknown function (DUF2581)  39.55 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2559  Protein of unknown function DUF2581  33.33 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.260475  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2055  hypothetical protein  38.32 
 
 
151 aa  58.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3113  hypothetical protein  27.59 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272231  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2974  hypothetical protein  35.42 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26731  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2837  hypothetical protein  35.05 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.36145  normal  0.0579285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1082  hypothetical protein  25 
 
 
156 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0863  Protein of unknown function DUF2581  35.61 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17667  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2992  hypothetical protein  28.86 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.10835  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16060  Protein of unknown function (DUF2581)  29.29 
 
 
154 aa  44.7  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.199919  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18200  Protein of unknown function (DUF2581)  35.11 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1864  Protein of unknown function DUF2581  38.24 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0408425  normal  0.232813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2453  hypothetical protein  33.67 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1376  hypothetical protein  31.54 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.486937 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4184  hypothetical protein  47.17 
 
 
202 aa  41.2  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>