36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1220 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1220  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  730    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3180  hypothetical protein  49.45 
 
 		 362 aa  338  8e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2662  hypothetical protein  46.98 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4800  hypothetical protein  46.85 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.502429  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0829  hypothetical protein  40.57 
 
 		 364 aa  266  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322007  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3086  catalase  43.18 
 
 		 364 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0869  hypothetical protein  40 
 
 		 364 aa  260  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3406  catalase  42.35 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1393  hypothetical protein  40.24 
 
 		 363 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6095  catalase  39.66 
 
 		 360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0795  hypothetical protein  40.06 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  0.0287536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1687  hypothetical protein  39.89 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.716667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3994  hypothetical protein  38.76 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4064  hypothetical protein  40.16 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0319  catalase  38.83 
 
 		 360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3256  catalase  38.75 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0658316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0318  catalase  38.07 
 
 		 370 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4816  hypothetical protein  39.38 
 
 		 457 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6096  catalase  35.98 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0738  hypothetical protein  40.11 
 
 		 455 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5311  catalase  39.62 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2562  catalase  38.14 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7585  Catalase  36 
 
 		 358 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0903  catalase  38.14 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.822977  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3760  catalase  34.39 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4430  hypothetical protein  31 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122102 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1217  hypothetical protein  29.49 
 
 		 383 aa  161  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1213  hypothetical protein  33.82 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329567 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2051  hypothetical protein  28.31 
 
 		 383 aa  142  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2246  hypothetical protein  28.9 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0531  hypothetical protein  31.96 
 
 		 401 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1669  hypothetical protein  29.97 
 
 		 388 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198868  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2166  hypothetical protein  32.46 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0255897  hitchhiker  0.00875673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39460  hypothetical protein  29.92 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000677129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3352  hypothetical protein  29.66 
 
 		 379 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0826  hypothetical protein  26.05 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>