15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1118 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1118  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  673    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.301061  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4444  hypothetical protein  48.98 
 
 
363 aa  299  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4428  hypothetical protein  48.98 
 
 
375 aa  299  5e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0643  hypothetical protein  50.95 
 
 
550 aa  243  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.24252  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28850  hypothetical protein  36.86 
 
 
391 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.190647 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3460  hypothetical protein  34.69 
 
 
386 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04420  hypothetical protein  32.96 
 
 
378 aa  135  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129632  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2199  hypothetical protein  25.71 
 
 
369 aa  125  8.000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31820  hypothetical protein  29.34 
 
 
344 aa  115  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07200  hypothetical protein  30.1 
 
 
434 aa  99  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.287125  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4332  hypothetical protein  36.88 
 
 
165 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1302  hypothetical protein  29.3 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1137  hypothetical protein  26.92 
 
 
436 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2887  hypothetical protein  30.12 
 
 
398 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.286834  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3566  hypothetical protein  28.76 
 
 
418 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.153773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>